审计调查发现，深圳市科技研发资金管理未严格执行相关规定，资金后续检查监督、验收评估不到位，部分项目到期没有验收评估。科技研发资金计划下达滞后，08年年底有14类807个项目2.65亿元计划资金未拨付，占当年资金计划总额的35.33%。个别单位存在挪用专项资金的情况，例如深圳市精联通信技术优先公司在获得政府科技研发资金无息贷款500万元以后，将其中的450万元转入了股票保证金账户，用于股票投资。